Banca de DEFESA: Otaviano Martins Monteiro

Uma banca de DEFESA de MESTRADO foi cadastrada pelo programa.
DISCENTE : Otaviano Martins Monteiro
DATA : 25/08/2017
HORA: 14:00
LOCAL: Auditório Prédio 17- DECOM, sala 401 - Campus II, CEFET-MG Av. Amazonas, 7675 - Nova Gameleira
TÍTULO:

Uso de Uma Metodologia Baseada em Matriz de Distâncias na Verificação de Similaridades de Proteínas

PALAVRAS-CHAVES:

Proteínas. LSQKAB. Matriz de distâncias. Agrupamentos.

PÁGINAS: 64
RESUMO:

As proteínas são macromoléculas presentes em todos os seres vivos e desempenham funções importantes, tais como manutenção de órgãos e tecidos, diferenciação celular, transporte, entre outras diversas finalidades. Várias proteínas, possuem a sua estrutura tridimensional resolvida e armazenada em bancos de dados biológicos, como o Protein Data Bank (PDB). Existem diversos softwares que trabalham com informações extraídas do PDB. Algumas dessas ferramentas, tem como função a verificação de similaridades entre estruturas proteicas. Um exemplo é o LSQKAB, que pertence ao pacote CCP4, e tem o seu funcionamento baseado no algoritmo de Kabsch, uma técnica frequentemente utilizada na área de bioinformática. Este trabalho tem como objetivo desenvolver uma metodologia baseada em uma matriz de distâncias, que verifique a similaridade de trechos de proteínas. A sua precisão deve ser a mesma do LSQKAB e ainda deve ser possibilitado o agrupamento de resíduos de acordo com as similaridades de seus valores de distâncias atômicas. Os experimentos foram realizados com arquivos de interações de resíduos de uma mesma proteína e os resultados foram comparados com o Cutoff Scanning Matrix (CSM) e com a técnica do arquivo de referência, utilizada na busca de pares interagentes pela ferramenta RID.  Foi possível formar diversos grupos com arquivos similares através de cada técnica avaliada. A metodologia apresentada obteve resultados interessantes diante das outras técnicas comparadas, obtendo uma maior precisão.

MEMBROS DA BANCA:
Interno - ANISIO MENDES LACERDA
Externo à Instituição - ANTON SEMENCHENKO - CEFET-MG
Externo ao Programa - JOAO FERNANDO MACHRY SARUBBI
Interno - THIAGO DE SOUZA RODRIGUES